Но духовно обитель старца Амвросия не погибла. Она продолжала жить в молитвах как Церкви Торжествующей, так и в молитвах Церкви воинствующей, среди членов которой подвизалась схимонахиня Серафима Бобкова, поступившая в Шамординский монастырь послушницей в 1908 г. Как только в 1988 г. начала возрождаться Оптина пустынь, старица стала писать тогдашнему наместнику архимандриту Евлогию (ныне архиепископ Владимирский и Суздальский): «Возьми меня в Шамордино. Пришлось отцу наместнику хлопотать об открытии Шамординского монастыря.

В марте 1990 г. в Шамордино вновь зажглись лампады, началось Богослужение. 20.04/3-05-1990 г. Святейший Патриарх Московский и Всея Руси Пимен подписал Указ о возобновлении монастыря в Шамордино. За 20 дней храм в честь иконы Божией Матери «Утоли моя печали» был подготовлен к освящению, которое совершилось 14/27 мая 1990 г. Монахиня Рижского Свято-Троице-Сергиева монастыря Никона Перетягина была возведена в сан игумений, духовником обители назначен насельник Троице-Сергиевой Лавры игумен Поликарп Нечипорук. Восемь первых насельниц стали послушницами.